雞糞在所有禽畜糞便中養(yǎng)分高、是有機肥生產的好原材料，但如果未經充分發(fā)酵或腐熟而直接施用到作物上，則存在很大的害處：

1.傳染病蟲害：

雞糞中含有大腸桿菌、線蟲等病菌和害蟲，直接使用會導致病蟲害的傳播，作物發(fā)病，對食用農產品的人體健康也產生影響;未腐熟的雞糞在土壤中發(fā)酵時，容易滋生病菌與蟲害的發(fā)生。 

2.發(fā)酵燒苗 

發(fā)酵不充分的雞糞施到地里后，當發(fā)酵條件具備時，雞糞便開始發(fā)酵，若發(fā)酵部位距根部較近，且作物植株較小，發(fā)酵產生的熱量會影響作物生長，嚴重時導致植株死亡。

3.酸化果園

土壤雞糞是強酸性肥料(PH值為3.6～4.7)，因此在果園里施用酸性雞糞無異于;雪上加霜，造成果樹爛根、黑根、黃葉、樹勢早衰、黃化病，嚴重時導致柑桔植株死亡。 

4.毒氣危害

在分解過程中產生甲烷、氨等有害氣體，使土壤和作物產生酸害和根系損傷，更重要的是產生的乙烯氣體有抑制根系生長的作用，也是燒根的主要原因

 5.土壤缺氧

有機質在分解過程中消耗土壤中的氧氣，使土壤暫時性的處于缺氧狀態(tài)，會使作物生長受到抑制。

6.肥效緩慢

未發(fā)酵腐熟的雞糞中，養(yǎng)分多為有機態(tài)或緩效態(tài)，不能被作物直接吸收利用，只有分解轉化成速效態(tài)，才能被作物吸收利用。所以未發(fā)酵直接施用使肥效減慢。

7.重金屬超標

雞糞中含有很高量的銅、汞、鉻、鎘、鉛、砷等重金屬，還有較多的激素殘留，造成農產品重金屬超標，給食品安全、柑桔產業(yè)的可持續(xù)發(fā)展埋下隱患。

8.利用不便、效率低

 未經處理的糞便，不易運輸，體積大，有效成分低，使用成本高。有機物向腐殖質轉化的時間較長，養(yǎng)分流失嚴重。在雞糞堆制發(fā)酵過程中微生物菌群以輔料為載體與雞糞組成復雜而穩(wěn)定的微生態(tài)系統，能夠快速使雞糞發(fā)酵制成肥料或飼料。 

     所以雞糞一 定要經過發(fā)酵處理才能進行深加工或者再利用，雞糞進行發(fā)酵處理，不僅能殺蟲滅菌，還可提高雞糞的肥效，使用安全方便，抗病促長，更不會造成燒根燒苗的現象，可以保證農作物的高效生長，同時也減少了農民給農作物噴灑農藥的步驟，大大節(jié)省了農藥成本。